The Johann Wolfgang Goethe University Frankfurt am Main is one of the largest univer­sities in Germany with around 44,000 students and with about 5,700 employees. Founded in 1914 by Frankfurt citizens and since 2008 once again proud of its foundation status Goethe University possesses a high degree of autonomy, modernity and profes­sional diversity. As a compre­hensive university, the Goethe University offers a total of 16 depart­ments on five campuses and 154 degree programs along with an outstanding research reputation. Furthermore the Goethe University is part of the Group of Rhine-Main-Univer­­­­­sities (RMU).

The research grout Wildlife/Zoo Animal Biology and Syste­matics in the Institute of Ecology, Evolution and Diversity, Faculty of Biosci­ences at Goethe University Frankfurt is looking at the earliest possible date for a

 Research Associate (m/f/d)

Doktoral Candidate

(E 13 TV‑G‑U, 65% part-time)

limited for 3 years. The salary grade is based on the job charac­te­ristics of the collective agreement (TV‑G‑U) appli­cable to Goethe University.

Among other things, our department inves­ti­gates the use of phero­mones for chemical commu­ni­cation in Neotro­pical frogs. The focus of the vacant position is on the molecular biolo­gical and genomic analysis of protein phero­mones. The tasks include a combi­nation of field work in the Neotropics, laboratory work (RNA sequencing, histology) and in parti­cular bioin­for­matic, statis­tical and phylo­ge­netic data analysis. The position is part of the DFG third-party funding project „Function and develo­pment of male nuptial pads in frogs: from the better-grip-theory to the transfer of sex phero­mones”. The position serves the scien­tific quali­fi­cation, especially in the context of a doctorate degree.

Your respon­si­bi­lities will include :

• sampling of Neotro­pical frogs in the field
• independent perfor­mance of various molecular and genomic analyses
• bioin­for­matic, statis­tical and phylo­ge­netic analyses of RNAseq data
• histo­lo­gical tissue analyses
• writing publi­ca­tions

Requi­re­ments:

• a completed scien­tific university degree (Master) in the field of biology (specia­lized in zoology, evolu­tionary ecology or related fields)
• good bioin­for­matic knowledge and/or phylo­ge­netic skills
• willingness to carry out animal experi­ments
• very good written and spoken English language skills
• field experience (preferably in the Neotropics) and a good knowledge of the Spanish language are desirable

We offer you :

• a research-interested inter­na­tional team
• a versatile and interesting job in a dynamic work environment
• flexible working hours and the oppor­tunity to work remotely
• a Landes­Ticket Hessen for free travel on public transport throughout Hessen
• regular further education oppor­tu­nities
• compa­ti­bility of family and career

The Goethe University is committed to a policy of providing equal employment oppor­tu­nities for both men and women alike, and therefore encou­rages parti­cu­larly women to apply for the position/s offered. Indivi­duals with severe disability will be priori-tized in case of equal aptitiude and ability.

Please send appli­ca­tions, including a cover letter, CV, certi­fi­cates, and the contact infor­mation of two referees/references in electronic form (summa­rised in one PDF file with max. 8 MB) by 05.11.2024 via e‑mail schulte@bio.uni-frankfurt.de to Prof. Dr. Lisa M. Schulte. The Goethe University cannot reimburse any costs incurred in the appli­cation process.

Das Compre­hensive Cancer Center (G‑CCC) der Univer­si­täts­me­dizin Göttingen (UMG) sucht zum nächst­mög­lichen Zeitpunkt eine/n

Informatiker*in für Medizi­nische Daten­ver­ar­beitung und Schnitt­stel­len­ent­wicklung (w/m/d)

zunächst befristet auf 2 Jahre (Vollzeit/Teilzeit | Entgelt nach TV‑L)

Über uns

Die Univer­si­täts­me­dizin Göttingen (UMG) umfasst die Medizi­nische Fakultät und das Univer­si­täts­kli­nikum. Mit über 7.900 Mitar­bei­te­rinnen und Mitar­beitern ist die UMG einer der größten Arbeit­geber in der Region. Mehr als 65 Kliniken, Institute und Abtei­lungen stehen für eine quali­tativ hochwertige Patien­ten­ver­sorgung, exzel­lente Forschung und moderne Lehre. Göttingen als Stadt der Wissen­schaft liegt im Zentrum Deutsch­lands und die Univer­si­täts­me­dizin ist vor Ort einge­bunden in ein attrak­tives Netzwerk univer­si­tärer und außer­uni­ver­si­tärer Wissen­schafts­ein­rich­tungen.

Das Univer­si­täts­Krebs­zentrum (G‑CCC) ist ein inter­dis­zi­pli­näres Zentrum, unter dessen Dach alle onkolo­gisch tätigen Kliniken und Institute der UMG vereint sind. Zusammen mit der Medizi­ni­schen Hochschule Hannover (MHH) sind wir das Compre­hensive Cancer Center Nieder­sachsen (CCC‑N) und damit eins von 14 Onkolo­gi­schen Spitzen­zentren, die von der Deutschen Krebs­hilfe gefördert werden.

Ihre Aufgaben:

• IT-Support / User-Helpdesk für das G‑CCC, das Krebs­re­gister und das Tumor­do­ku­men­ta­ti­ons­system Onkostar
• (technische) Weiter­ent­wicklung der Tumor­board­module für Tumor­boards des G‑CCC
• Einrichtung und Betreuung von Onkostar für Partner­kli­niken und Partner­praxen
• Konzept­erstellung, Imple­men­tierung und Betreuung von Schnitt­stellen zwischen Onkostar und Subsys­temen innerhalb der UMG
• Erstellung und Pflege von ETL Pipelines
• Erstellung von Formu­laren
• Daten­bank­ab­fragen
• Etablierung von Prozess­work­flows in Koope­ration mit den Fachab­tei­lungen
• Mitarbeit in natio­nalen Projekten mit anderen Stand­orten zur Entwicklung gemein­samer Daten­nutzung
• Zusam­men­arbeit mit dem Rechen­zentrum der UMG, der Gesell­schaft für wissen­schaft­liche Daten­ver­ar­beitung mbH Göttingen (GWDG), dem Institut für Medizi­nische Bioin­for­matik und anderen Forschungs­ein­rich­tungen sowie dem Medizi­ni­schen Daten­in­te­gra­ti­ons­centrum (MeDIC) der UMG
• Entwicklung von Plugins für unser Tumor­do­ku­men­ta­ti­ons­system,
• Entwicklung von Tools und Skripten zur Digita­li­sierung von Prozessen

Ihre Quali­fi­ka­tionen:

• Hochschul­ab­schluss in Medizin­in­for­matik, Bioin­for­matik, Infor­matik oder vergleichbare Quali­fi­kation
• erfolg­reich abgeschlos­senes Studium im Infor­matik oder IT-Bereich, oder abgeschlossene Ausbildung zur/zum Fachinformatiker*in, oder vergleichbare Berufserfahrung/Qualifikation
• fortge­schrittene Erfahrung mit verschie­denen Program­mier­sprachen (z. B. Python, Java, JavaScript)
• Erfah­rungen mit verschie­denen DBMS (z. B. MySQL, Postgres, Access)
• Erfahrung mit Tools und Frame­works wie z. B. nginx, Flask, Spring, maven, Docker
• sicherer Umgang auf der Komman­do­zeile (Linux)
• Erfahrung in der Zusam­men­arbeit mit Fachab­tei­lungen
• rasche Auffas­sungsgabe von fachfremden Themen
• sehr gutes Organi­sa­ti­ons­ver­mögen, hohe Service­ori­en­tierung und sehr gute Kommu­ni­ka­ti­ons­fä­higkeit in deutscher Sprache
• Arbeiten mit komplexen Daten­struk­turen
• selbstän­diges und zielstre­biges Arbeiten sowie Teamgeist
• Erfahrung im agilen Projekt­ma­nagement wünschenswert

Wir bieten:

• Entwick­lungs­mög­lich­keiten in einem sehr inter­es­santen Umfeld der Medizi­ni­schen Infor­matik
• eine anspruchs­volle und vielseitige Tätigkeit im inter­dis­zi­pli­nären Umfeld
• gute Arbeits­be­din­gungen in einem engagierten und motivierten Team
• ein betrieb­liches Gesund­heits­ma­nagement
• ein umfang­reiches Fort- und Weiter­bil­dungs­an­gebot

Unser Ziel als Univer­si­täts­me­dizin Göttingen ist die beruf­liche Gleich­stellung aller Geschlechter. Wir streben in Bereichen, in denen eine Unter­re­prä­sen­tation vorliegt, eine Anglei­chung des Geschlech­ter­ver­hält­nisses an.

Der beruf­lichen Teilhabe von schwer­be­hin­derten Menschen sieht sich die Univer­si­täts­me­dizin Göttingen in beson­derer Weise verpflichtet und begrüßt deshalb Bewer­bungen schwer­be­hin­derter Menschen. Bei gleicher Eignung werden Bewer­bungen schwer­be­hin­derter Personen nach Maßgabe der einschlä­gigen Vorschriften bevorzugt berück­sichtigt. Wir bitten Sie, eine Behinderung/Gleichstellung zur Wahrung Ihrer Inter­essen bereits im Bewer­bungs­schreiben anzugeben.

Wir freuen uns auf Ihre Bewerbung über das offizielle Portal: https://umg.recruiting-portal.com/r/z107dxkxdjofihx/Informatiker*in+f%C3%BCr+Medizinische+Datenverarbeitung+und+Schnittstellenentwicklung+wmd/37075/G%C3%B6ttingen

At the University Hospital of Giessen and Marburg, Institute of Pathology, Gießen we are seeking a PostDoc or PhD for the Department of Molecular Cytology and Functional Genomics

The position is initially limited to 3 years, part-time (75%).

Research Environment

Molecular Cytology and Functional Genomics

The Department of Molecular Cytology and Functional Genomics employs a multi­di­sci­plinary approach combining genetic, cell biolo­gical, and bioche­mical inves­ti­ga­tions to identify and functionally charac­terize the trans­forming events involved in the patho­ge­nesis of B‑cell lymphomas. The results of these studies lead to improved diagnosis of these diseases and are used to develop prognostic markers for therapy. In addition, new thera­peutic strategies are designed and validated in precli­nical studies.

Research Project — Liquid Biopsies of Aggressive B‑cell Lymphoma

After deter­mining the genetic lesions of a B‑cell lymphoma at the time of diagnosis, high-throughput sequencing is subse­quently performed using blood samples from these patients, both during and after therapy. The so-called liquid biopsy procedure usually allows for the detection of tumor DNA in the blood of patients at the beginning of therapy. Studies with these methods in NHL patients show that there is a corre­lation between the response to therapy and the detec­ta­bility of tumor DNA in the blood. Accor­dingly, the detection of tumor DNA in the blood allows the course of therapy to be monitored closely. After completion of therapy, the ultra­sen­sitive detection of circu­lating tumor DNA allows early predic­tions of possible relapses or trans­for­ma­tions of the B‑cell lymphoma.

Your profile

• Master or PhD degree in bioinformatics/computational biology, genomics or a related area
• Extensive experience with at least one programming language (e.g., R, Python, etc.).
• You have an interest in inter­di­sci­plinary colla­bo­ration.
• Dedication, team spirit, and a high degree of respon­si­bility.
• Very good English skills, both written and spoken.

We Offer

• A scien­tific project in the field of trans­la­tional cancer research.
• Excellent, inter­di­sci­plinary super­vision by a Principal Inves­ti­gator and Postdocs, as well as support for the sustainable develo­pment of your scien­tific profile.
• Oppor­tunity to pursue a doctorate (PhD).
• Oppor­tunity to analyze a broad spectrum of high-throughput sequencing data (including analysis of circu­lating tumor DNA using PhasED-Seq, exome sequencing, RNA-seq, etc.).
• Focus institute “Liquid Biopsy” within the framework of the “CCC Hessen” initiative.
• Innovative concepts in digital higher education.
• Support for external conti­nuing education and training.

How to apply:

Please send your appli­cation documents to roland.schmitz@patho.med.uni-giessen.de until October 20th, 2024, including:

 a CV with publi­cation list (if available)

a summary of previous research experience (max 1 page)

copies of certi­fi­cates, transcripts and grades

For more infor­mation about the lab and project, please contact Prof. Dr. rer. nat. Roland Schmitz roland.schmitz@patho.med.uni-giessen.de.