An unserem Forschungs- & Entwick­lungs­standort in Halle (Saale) arbeiten wir an der Identi­fi­zierung und Validierung neuer Krebstargets als Grundlage für die compu­ter­ba­sierte und experi­men­telle Entwicklung poten­zi­eller Wirkstoffe in der Krebs­me­dizin. Daher sind wir gegen­wärtig auf der Suche nach einem/r Bioinformatiker/in (m/w/d) zur Verstärkung unseres Labor­teams im Biozentrum in Halle (Saale) in Teilzeit.

Aufgaben:

• Unter­stützung in der IT-Infra­­­struktur
• Entwicklung und Pflege von Daten­banken
• Erstellung von Bildana­ly­se­pipe­lines
• Analyse von transkrip­to­mi­schen Daten­sätzen (bulk-RNAseq)
• Zusam­men­arbeit in einem inter­na­tio­nalen Team und mit Koope­ra­ti­ons­partnern

Anfor­de­rungs­profil:

• Abgeschlos­sener Hochschul­ab­schluss im Bereich der Bioin­for­matik, Biosta­tistik oder einer verwandten Disziplin aus den Lebens­wis­sen­schaften mit Fokus auf Bioin­for­matik
• Sehr gute Program­mier­kennt­nisse in R / Biocon­ductor und/oder Python
• Vorzugs­weise Erfahrung mit der Einrichtung und Pflege von Daten­banken (MySQL)
• Vorzugs­weise Kennt­nisse in Tumor­bio­logie
• Zuver­läs­siges, selbstän­diges und verant­wor­tungs­be­wusstes Arbeiten
• Teamfä­higkeit, Flexi­bi­lität und Organi­sa­ti­ons­fä­higkeit
• Sehr gute Englisch- und Deutsch­kennt­nisse in Wort und Schrift

Sie erwartet eine inter­es­sante und verant­wor­tungs­volle Tätigkeit in einem inter­na­tional agierenden Unter­nehmen auf dem Gebiet der Krebs­for­schung. Wenn wir Ihr Interesse geweckt haben, freuen wir uns auf Ihre aussa­ge­kräftige Bewerbung per E‑Mail unter Angabe Ihrer Gehalts­vor­stellung und Ihrem möglichen Eintritts­termin. Bitte senden Sie Ihre vollstän­digen Bewer­bungs­un­ter­lagen (Anschreiben, Lebenslauf, relevante Zeugnisse und Zerti­fikate) als ein PDF-Dokument an: info@rgcc-centraleurope.com Bei Rückfragen stehen wir Ihnen gerne zur Verfügung.

Postdoc in Compu­ta­tional Biology

Leading the EpiFlaMe consortium
(Memory in Epithelial Cells — Organ Speci­ficity and Cancer)

The group: The candidate will be part of the Compu­ta­tional Systems Biology group at the University of Salzburg, which is headed by Nikolaus Fortelny (https://plus.ac.at/fortelny). The group is focused on integrating single-cell/s­­­patial multi-omics data with biolo­gical knowledge using AI/ML and other compu­ta­tional approaches in cancer and immunology research. We focus on approaches that produce robust, reliable, and ideally inter­pr­e­table results.

The project: EpiFlaMe (Memory in Epithelial Cells — Organ Speci­ficity and Cancer: https://plus.ac.at/epiflame) is a large consortium of seven research groups dedicated to under­standing inflamm­atory memory in epithelia. The postdoc will be supported by a bioin­for­matics technician to coordinate and perform integrative bioin­for­matic data analysis of multi-omics profiles generated by these various groups, focusing on producing a consortium flag-ship publi­cation (similar to Fortelny et al., Nature Immunology, 2024). The project focuses on under­standing epithelial inflamm­atory memory and its relati­onship with cancer develo­pment. Using multi-omics profiling, innovative organoid cell cultures and in-vivo models the consortium will create the first syste­matic molecular map of inflamm­atory memory in epithelial cells across multiple organs. The goal of the EpiFlaMe research program is to lay the foundation for future therapies that can treat chronic inflamm­atory diseases and help prevent tumor formation in an organ-specific way.

The place: The city of Salzburg has ample natural and cultural attrac­tions as well as fast connec­tions to Vienna and Munich. It is surrounded by beautiful lakes and mountains, with various oppor­tu­nities for recrea­tional and sports activities. The university has 18 000 students, and a highly colla­bo­rative research environment in both biome­dical and compu­ta­tional sciences.

Quali­fi­ca­tions:
* PhD in biology, bioin­for­matics, biotech­nology, computer science, statistics, physics, or similar
* Excellent scien­tific thinking and commu­ni­cation, high level of motivation and drive
* Programming (R/python) and other quanti­tative skills (statistics, AI/ML, network biology)
* Experience with (multi-)omics integrative data analysis, single-cell / spatial data, and/or CRISPR screens
* An under­standing of and interest in immunology
* Excellent English and commu­ni­cation skills, especially commu­ni­cation with wet-lab biolo­gists

Details:
* Start date: as soon as possible
* Duration: end of 2029 (project may then be prolonged for 4 years)
* Salary and work hours according to Austrian funding regula­tions
* Place of work: Salzburg, Austria

Our offer:
* Experience in coordi­nating a large research consortium focused on how immunology drives cancer
* Cutting-edge academic environment (https://scholar.google.at/citations?user=IHjaqgkAAAAJ)
* Being part of an inter­na­tional, inter­di­sci­plinary, and fun team and consortium
* Oppor­tu­nities for self-growth through courses for hard and soft skills
* Parti­ci­pation in confe­rences and project meetings
* Excellent social benefits of working in Austria (holidays, health insurance)
* Environment that values a healthy work / life balance

Appli­cation:
https://survey.plus.ac.at/index.php/282137

Deadline:
None — we hire on a rolling basis.

We look forward to hearing from you!