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Veröf­fent­licht: 4. February 2026

Postdoc Oppor­tu­nities: Cancer Genomics for Regulatory RNA Thera­peutics

Postdoc Oppor­tu­nities: Cancer Genomics for Regulatory RNA Thera­peutics

Are you an ambitious researcher looking for a challenge at the forefront of cancer, genome editing and RNA thera­peutics?

The Laboratory for Genomics of Long Noncoding RNAs and Disease (GOLD Lab) is hiring! Based in the Conway Institute at University College Dublin (Ireland), we are an inter­di­sci­plinary team of passionate resear­chers dedicated to under­standing the roles of long non-protein-coding RNAs (lncRNAs) in disease. We love to create new tools based on CRISPR-Cas genome editing and bioin­for­matics to discover new and interesting lncRNAs. We parti­cipate actively in major inter­na­tional consortia (Genomics England, GENCODE, FANTOM).

We strive to foster a supportive, colla­bo­rative, successful and fun lab community.

The Project: We have openings for two Postdoc­toral Resear­chers funded by a presti­gious Research Ireland (SFI) Frontiers for the Future Award. This project will inves­tigate how tumour mutations act through lncRNAs to drive cancer, and how we can harness this for novel therapies. Our unique dataset is 16,000 whole tumour genomes from Genomics England. We will apply cutting edge methods including advanced genome editing (Prime editing, CRISPRi), oligo­nu­cleotide thera­peutics and machine learning. The project will benefit from world-leading Colla­bo­rators Catriona Dowling (RCSI, disease modelling) and Colm Ryan (UCD, computer science).

We are recruiting two distinct profiles:

🧬 Postdoc 1: Experi­mental Researcher

You will lead the biolo­gical discovery and thera­peutic proof-of-concept aspects.

  • Respon­si­bi­lities: High-throughput genome editing for functional screening, validation in advanced models including 3D spheroids and in vivo, and pre-clinical testing of antisense oligo­nu­cleo­tides (ASOs).
  • Requi­re­ments: Strong background in molecular/cancer cell biology. Experience with genome editing, RNA biology, or functional cancer assays is highly desirable.

💻 Postdoc 2: Bioin­for­matic Researcher

You will lead the compu­ta­tional discovery and mecha­nistic prediction of driver mutations using patient cohort data.

  • Respon­si­bi­lities: Driver gene discovery from 16,000+ tumours, multi-omic integration to predict molecular mecha­nisms, processing NGS data from genome editing screens.
  • Requi­re­ments: PhD in Bioin­for­matics, Compu­ta­tional Biology, Statistics or similar. Profi­ciency in Python/R and experience working in a scien­tific computing environment. Experience with cancer genomics, molecular evolution or NGS data analysis is highly desirable.

We are searching for colla­bo­rative, independent, self-motivated creative thinkers.

What we offer:

To Apply: Send your CV and a brief motivation message to Dr. Rory Johnson (rory.johnson [at] ucd.ie) with the subject line “RIBOn­cology Recruitment”. Please indicate clearly which role you are applying for and where you heard about this oppor­tunity. Informal enquiries are welcome. Inter­views are envisaged to take place in April 2026, and the project will commence there­after.

Website: https://www.gold-lab.org/ Twitter: @GOLDLab_UCD

Selected recent publi­ca­tions:

  • Targeting and engineering long non-coding RNAs for cancer therapy. Coan et al. Nature Reviews Genetics (2024).
  • Tumour mutations in long noncoding RNAs enhance cell fitness. Esposito, Lanzós et al. Nature Commu­ni­ca­tions (2023).
  • Multi-hallmark long noncoding RNA maps reveal non-small cell lung cancer vulnerabi­lities. Esposito, Polidori et al. Cell Genomics (2022).
  • Analyses of non-coding somatic drivers in 2,658 cancer whole genomes. Rheinbay et al. (PCAWG Consortium). Nature (2020).

(Full publi­cation list here: https://tinyurl.com/goldlabpubs)

Website: https://www.gold-lab.org/

Twitter: @GOLDLab_UCD

Veröf­fent­licht: 19. January 2026

Systementwickler*in (m/w/d) — AG Genom­in­for­matik

Bei dem Deutschen Netzwerk für Bioin­­­­­for­­­matik-Infra­­­struktur „de.NBI“ handelt es sich um eine vom Forschungs­zentrum Jülich (Standort Bielefeld) koordi­nierte verteilte Infra­struk­tur­ein­richtung, in der dezentral bioin­for­ma­tische Services angeboten werden, Projekt­support geleistet wird und Trainings­kurse angeboten werden. Weiterhin wird eine verteilte Rechen­in­fra­struktur betrieben, die de.NBI-Cloud.

Am Biele­felder Institut für Bioin­­­­­for­­­matik-Infra­­­struktur (BIBI) der Techni­schen Fakultät und am Centrum für Biotech­no­logie (CeBiTec) ist ein Teil des dem de.NBI-Netzwerk angehö­rigen „Bielefeld-Gießen Resource Center for Microbial Bioin­for­matics (BiGi)“ angesiedelt, das verschiedene Dienste in den Bereichen Metage­nomik, Pange­nomik, MultiOmics, BiBiServ und Bild-/Video­an­­­no­­­tation anbietet. Weiterhin wird ein Teil der de.NBI-Cloud an der Univer­sität Bielefeld betrieben und konzep­tionell weiter­ent­wi­ckelt, insbe­sondere im Bereich Workflow-Management.

Die Stelle ist in Vollzeit zum 01.04.2026 zu besetzten und bis 31.12.2027 (Projek­tende) befristet.
Vergütung erfolgt nach TV‑L E13.
Nähere Infor­ma­tionen — was wir erwarten, Ihnen als Arbeit­geber bieten, sowie die Möglichkeit der Bewerbung und einen Ansprech­partner — entnehmen Sie gerne der Stelle­aus­schreibung unter
https://uni-bielefeld.hr4you.org/job/view/4719/wissenschaftliche-r-mitarbeiter-in-systementwickler-in-m-w-d-ag-genominformatik?page_lang=de

Veröf­fent­licht: 6. January 2026

PhD candi­dates (f/m/d) in the field of Medical Bioin­for­matics

The Institut für Medizi­nische Bioin­for­matik of the University Medical Center Göttingen is looking for a new position for the earliest start date

PhD candi­dates (f/m/d) in the field of Medical Bioin­for­matics

part time, 25 hours per week, 24 months

Our institute is a leader in the bioin­for­matic analysis of genetic high-throughput data, parti­cu­larly in the develo­pment of biomarker signa­tures and advanced approaches of machine learning for perso­na­lized and systems medicine.
Within different DFG or BMBF funded Colla­bo­rative Reserach Projects focused on for instance on pancreatic cancer, colorectal cancer, we pioneer the develo­pment of innovative computer-assisted methods in bioin­for­matics and artificial intel­li­gence. This includes the analysis and integration of various OMICs data, including genomics, transcrip­tomics, and spatial transcrip­tomics.PhD Topics:
Within these research groups, we offer ambitious young scien­tists the oppor­tunity to work at the forefront of research in Medical Bioin­for­matics. Possible topics for doctoral theses are deeply rooted in the analysis of complex datasets and the develo­pment of methods essential for progress in the treatment of pancreatic and colorectal cancer.

Furthermore in context of our new project GöNoMix, we develop compu­ta­tional methods to recon­s­truct gene regulatory networks (GRNs) in emerging model organisms. We integrate ATAC-seq, RNA-seq and TFBS analyses, model WNT signaling, improve machine-learning methods and create tools for cross-species compa­risons.

We are looking for PhD candi­dates interested in statis­tical data analysis, machine learning methods, gene regulation, bioin­for­matics, and integrative omics approaches.

Your tasks

  • Support in the analysis of genomic data
  • Appli­cation and analysis of NGS-based data sets and pipelines
  • Appli­cation and further develo­pment of methods of artificial intel­li­gence and machine learning

Your quali­fi­ca­tions

  • Degree (Diploma/M.Sc.) in Biology, Computer Science, Bioin­for­matics, Data Science, or a related  field.
  • Basic under­standing of biolo­gical and biome­dical concepts
  • Expertise in computer science, data science, and machine learning
  • Profi­cient in programming languages such as Python, Java, R, or JavaScript
  • Enthu­siasm for working with complex data models
  • Interest in inter­di­sci­plinary colla­bo­ration
  • Excellent English language skills in both written and spoken; knowledge of German is advan­ta­geous
  • High motivation, teamwork, and initiative

We offer

  • Struc­tured and guided onboarding
  • Diverse activities in a multi­di­sci­plinary, inter­di­sci­plinary team
  • Support for internal and external training as well as scien­tific events
  • Parti­ci­pation in struc­tured PhD programs in Biology, Molecular Medicine, Computer Science, or Data Science

 

We look forward to receiving your appli­cation via our appli­cation portal!

Veröf­fent­licht: 6. January 2026

Wissenschaftliche(n) Mitarbeiter(in) / Bio- / Medizin-/ Informatiker:in (w/m/d)

Institut für Medizi­nische Bioin­for­matik der Univer­si­täts­me­dizin Göttingen sucht zum frühest­mög­lichen Eintritts­termin:

Bio-/Medizin-/Informatiker*in (w/m/d)

Teilzeit, 19,25 Stunden pro Woche, 12 Monate

Das Institut für Medizi­nische Bioin­for­matik arbeitet in Zusam­men­arbeit mit dem Göttinger Compre­hensive Cancer Center (G‑CCC) an trans­la­tio­nalen Forschungs­pro­jekten und der Digita­li­sierung der onkolo­gi­schen Versorgung. Der Forschungs­schwer­punkt der Medizi­ni­schen Bioin­for­matik liegt dabei auf der Analyse biome­di­zi­ni­scher Daten und deren Anwendung in der System­me­dizin. Wir entwi­ckeln und optimieren statis­tische und bioin­for­ma­tische Verfahren zur Auswertung hochdi­men­sio­naler Daten­sätze aus der biome­di­zi­ni­schen Forschung.
Das Univer­si­täts­Krebs­zentrum (G‑CCC) ist ein inter­dis­zi­pli­näres Zentrum, unter dessen Dach alle ökolo­gisch tätigen Kliniken und Institute der UMG vereint sind. Zusammen mit der Medizi­ni­schen Hochschule Hannover (MHH) fungiert es als Compre­hensive Cancer Center Nieder­sachen (CCCN) als eines der 15 Onkolo­gi­schen Spitzen­zentren, die von der Deutschen Krebs­hilfe gefördert werden.
Zur Unter­stützung unserer gemein­samen Projekte – insbe­sondere IMAGINE Nieder­sachsen – suchen wir zum nächst­mög­lichen Zeitpunkt Verstärkung.Im Rahmen von IMAGINE Nieder­sachsen entwi­ckeln wir ein digitales Unter­stüt­zungs­system zur Optimierung der vernetzten Krebs­ver­sorgung. Ziel ist es, Prozesse und Workflows sektoren­über­greifend zu harmo­ni­sieren, um eine patien­ten­freund­liche, standar­di­sierte und quali­tativ hochwertige Behandlung sicher­zu­stellen. Der Fokus liegt dabei auf der Vernetzung spezia­li­sierter Tumor­boards, der struk­tu­rierten Integration von Bildgebungs‑, Patho­­­logie- und klini­schen Daten sowie der Nutzung etablierter IT-Platt­­­formen und des Klini­schen Krebs­re­gisters Nieder­sachsen (KKN). Langfristig soll das Projekt eine nachhaltige, digital gestützte und quali­täts­kon­trol­lierte Vernetzung ermög­lichen, die über Nieder­sachsen hinaus Modell­cha­rakter für eine moderne onkolo­gische Versorgung haben kann.

Ihre Aufgaben

  • Erwei­terung unseres Tumor­do­ku­men­ta­ti­ons­ystems durch das Entwi­ckeln von Plugins
  • (Weiter-) Entwicklung von Prozessen zur Tumor­do­ku­men­tation in Zusam­men­arbeit mit externen
    Projekt­partnern und medizi­ni­schen Dokumen­taren
  • Entwicklung von Schnitt­stellen zum Austausch von Daten zwischen verschie­denen Klinik­sys­temen, Daten­bank­ab­fragen zur Daten­aus­wertung und –export
  • Etablierung von Prozess­work­flows in Koope­ration mit den Fachab­tei­lungen
  • Imple­men­tierung von Tools und Scripten zur Daten­ver­ar­beitung
  • Betreuung und Wartung von spezi­fi­schen Anwen­dungen aus dem Fachge­bieten des CCC
  • Fachüber­grei­fende Zusam­men­arbeit mit der Medizin­in­for­matik, der Bioin­for­matik, dem zentralen
    Rechen­zentrum sowie anderen Insti­tuten und Kliniken der UMG
  • Mitarbeit in Versor­gungs­for­schungs­pro­jekten, Entwicklung von Methoden zum daten­schutz­kon­formen Daten­aus­tausch mit Projekt­partnern bzw. Imple­men­tation der im Verbund entwi­ckelten Methoden an der UMG Zusam­men­arbeit mit dem Medizi­ni­schen Daten­in­te­gra­ti­ons­zentrum (MeDIC) der UMG zum Daten­aus­tausch und Pseud­ony­mi­sierung
  • Unter­stützung bei der Migration von trans­la­tio­nalen Forschungs­pro­jekten in die Routin­ever­sorgung
  • Erstellung und Pflege von Anfor­de­rungs­ana­lysen und Dokumen­ta­tionen

Ihre Quali­fi­ka­tionen

  • Hochschul­ab­schluss in der Fachrichtung Infor­matik, Bioin­for­matik, Medizi­nische Infor­matik, Data Science oder einem vergleich­baren Feld
  • Gutes Verständnis biome­di­zi­ni­scher Grund­lagen
  • Interesse an der Arbeit in einem inter­dis­zi­pli­nären Team
  • Gute Kennt­nisse in Python und Java, Kennt­nisse in R oder JavaScript sind vorteilhaft
  • Gute Kennt­nisse von Docker, Nginx etc sowie Erfahrung mit Betrieb von Anwen­dungen in komplexer Infra­struktur
  • Sichere Nutzung der Linux Shell
  • Gute Kennt­nisse in SQL, insbe­sondere für MySQL / MariaDB
  • Freude an der Arbeit mit komplexen Modellen
  • Sehr gute Deutsch- und Englisch­kennt­nisse in Wort und Schrift
  • Hohe Motivation, Teamfä­higkeit und Eigen­in­itiative

Wir bieten

  • Einen inter­es­santen Arbeits­platz in einem spannenden Bereich des Gesund­heits­wesens in einem motivierten, aufge­schlos­senen Team
  • Sorgfältige und quali­fi­zierte Einar­beitung und Unter­stützung bei der neuen Heraus­for­derung
  • Abwechs­lungs­reicher und verant­wor­tungs­voller Tätig­keits­be­reich mit indivi­du­ellen Entwick­lungs­mög­lich­keiten
  • Unter­stützung interner und externer Fort- und Weiter­bil­dungen sowie wissen­schaft­licher Veran­stal­tungen
  • Umfas­sende Angebote zur Gesund­heits­för­derung
  • Alle Leistungen des öffent­lichen Dienstes inkl. Zusatz­vor­sorge der Versor­gungs­an­stalt des Bundes und der Länder (VBL)

Wir freuen uns auf Ihre Bewerbung über unser Bewer­bungs­portal: UMG-Bewer­­­bungs­­­­­portal-Portal

Veröf­fent­licht: 12. December 2025

DASHH Call for Appli­ca­tions to the DAAD Graduate School Scholarship Programme

Are you a researcher outside Germany with a passion for data science? Have you considered a PhD in an inter­di­sci­plinary field to advance your career?

DASHH offers full-time GSSP scholar­ships for individual inter­di­sci­plinary PhD projects with a focus on struc­tural biology and computer science or applied mathe­matics in Hamburg, Germany. Together with two principal inves­ti­gators of our graduate school, you can develop an individual project proposal and apply for a three-year scholarship, which can be extended to up to four years.

Curious and want to learn more? Check the DASHH website at https://www.dashh.org/application/gssp_scholarships/index_eng.html.

The deadline for appli­ca­tions is March 1st, 2026.

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