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Veröf­fent­licht: 6. January 2026

a PhD Position on the Gut-Brain-Axis working with human cohorts

‘Forschungs­ge­sell­schaft für Arbeits­phy­sio­logie und Arbeits­schutz e.V. Dortmund’ (legal entity name) is a research insti­tution insti­tu­tio­nally funded by the German Federal Ministry of Labor and Social Affairs and the State of North Rhine-Westphalia. It is the sponsor of ’Leibniz Research Centre for Working Environment and Human Factors at TU Dortmund’ (IfADo). IfADo explores the risks and poten­tials of modern work in inter­di­sci­plinary approaches. We combine the disci­plines of Ergonomics, Immunology, Toxicology, Psychology and Neuro­sci­ences.

In the Department of Immunology at the Leibniz Research Centre for Working Environment and Human Factors (IfADo) we offer

a PhD Position on the Gut-Brain-Axis working with human cohorts (f/m/d) (65%)

The position is available immediately and limited to a period of 3 years.

Your task:

The applicant will be part of a research project in the Department of Immunology (Dr. Bloemendaal) inves­ti­gating the role of the gut micro­biota in the gut-immune-brain-axis, speci­fi­cally focusing on mental health, major depressive disorder and treatment response.

Your Quali­fi­ca­tions:

  • Master´s degree in one of the following subjects: psychology, medicine, micro­biology, biome­dical science, bioin­for­matics or related fields
  • Native speaker or excellent command of German and English
  • Experience in programming (in R) or motivation to learn and perform bioin­for­matic analyses of bacterial DNA (16S rRNA and shotgun metage­nomic data) in relation to health outcomes
  • Ability to liaise between disci­plines, bridging between medical infra­structure and clinical as well as basic research
  • Experience or interest in data analysis of patient cohorts and/or wet lab micro­biology techniques (e.g. batch fermen­tation or in vitro culturing) are considered a plus
  • The applicant should be able to work independently, translate research findings into scien­tific papers and present data at inter­na­tional confe­rences

 

We offer:

  • A part-time position with currently 25,89 hours per week
  • Remune­ration according to the collective agreement for the public service of the federal states (position value EG 13 TV‑L. The classi­fi­cation depends on the collective agreement and personal requi­re­ments)
  • All social benefits provided by working for the public service: e.g. an annual bonus, payment of benefits
  • Flexible working time models for the compa­ti­bility of family and career
  • An exciting project designed to identify targe­table microbes in the context of the gut-brain-axis. You will work on the forefront of inter­di­sci­plinary research, contri­buting to the develo­pment of inter­ven­tions and co-treat­­­ments aimed at supporting mental health and improved treatment outcomes (super­vision: Dr. Bloemendaal). You will be part of a unique team of inter­di­sci­plinary resear­chers, with access to an inter­na­tional network in fields of psycho-neuro-immunology and the gut-brain-axis. The Department of Immunology has modern laboratory and office space as well as material resources at its disposal.
  • You will have access to existing human cohorts as well as designing and setting-up your own clinical cohort.
  • Profes­sional develo­pment based on your interest is possible, in the form of courses and training on-the-job.
  • An interesting, versatile position that can be shaped by your personal commitment and interest.

The IfADo promotes profes­sional equality for all genders and is certified accor­dingly.

 

We value diversity and therefore welcome all appli­ca­tions — regardless of gender, disability, natio­nality or ethnic and social origin. Where appro­priate, there is also the possi­bility of part-time work.

General infor­mation about the IfADo can be found at www.ifado.de

If you have any questions, please contact us: Dr. Mirjam Bloemendaal, E‑Mail: bloemendaal@ifado.de

Interested?

Then please send your appli­cation documents (CV, letter of motivation, copy of graduation certi­fi­cates (university, school), (all in one single pdf!) including the reference code “Doktorand GutBrain 01_2025”until the 12.01.2026 preferably by mail to bewerbung@ifado.de.

Dortmund, 16th of December 2025

(*We ask you to submit appli­cation documents only in copies and not in folders as the documents are not returned. These will be destroyed by privacy after expiration of the retention period.)

Veröf­fent­licht: 6. January 2026

PhD candi­dates (f/m/d) in the field of Medical Bioin­for­matics

The Institut für Medizi­nische Bioin­for­matik of the University Medical Center Göttingen is looking for a new position for the earliest start date

PhD candi­dates (f/m/d) in the field of Medical Bioin­for­matics

part time, 25 hours per week, 24 months

Our institute is a leader in the bioin­for­matic analysis of genetic high-throughput data, parti­cu­larly in the develo­pment of biomarker signa­tures and advanced approaches of machine learning for perso­na­lized and systems medicine.
Within different DFG or BMBF funded Colla­bo­rative Reserach Projects focused on for instance on pancreatic cancer, colorectal cancer, we pioneer the develo­pment of innovative computer-assisted methods in bioin­for­matics and artificial intel­li­gence. This includes the analysis and integration of various OMICs data, including genomics, transcrip­tomics, and spatial transcrip­tomics.PhD Topics:
Within these research groups, we offer ambitious young scien­tists the oppor­tunity to work at the forefront of research in Medical Bioin­for­matics. Possible topics for doctoral theses are deeply rooted in the analysis of complex datasets and the develo­pment of methods essential for progress in the treatment of pancreatic and colorectal cancer.

Furthermore in context of our new project GöNoMix, we develop compu­ta­tional methods to recon­s­truct gene regulatory networks (GRNs) in emerging model organisms. We integrate ATAC-seq, RNA-seq and TFBS analyses, model WNT signaling, improve machine-learning methods and create tools for cross-species compa­risons.

We are looking for PhD candi­dates interested in statis­tical data analysis, machine learning methods, gene regulation, bioin­for­matics, and integrative omics approaches.

Your tasks

  • Support in the analysis of genomic data
  • Appli­cation and analysis of NGS-based data sets and pipelines
  • Appli­cation and further develo­pment of methods of artificial intel­li­gence and machine learning

Your quali­fi­ca­tions

  • Degree (Diploma/M.Sc.) in Biology, Computer Science, Bioin­for­matics, Data Science, or a related  field.
  • Basic under­standing of biolo­gical and biome­dical concepts
  • Expertise in computer science, data science, and machine learning
  • Profi­cient in programming languages such as Python, Java, R, or JavaScript
  • Enthu­siasm for working with complex data models
  • Interest in inter­di­sci­plinary colla­bo­ration
  • Excellent English language skills in both written and spoken; knowledge of German is advan­ta­geous
  • High motivation, teamwork, and initiative

We offer

  • Struc­tured and guided onboarding
  • Diverse activities in a multi­di­sci­plinary, inter­di­sci­plinary team
  • Support for internal and external training as well as scien­tific events
  • Parti­ci­pation in struc­tured PhD programs in Biology, Molecular Medicine, Computer Science, or Data Science

 

We look forward to receiving your appli­cation via our appli­cation portal!

Veröf­fent­licht: 6. January 2026

Wissenschaftliche(n) Mitarbeiter(in) / Bio- / Medizin-/ Informatiker:in (w/m/d)

Institut für Medizi­nische Bioin­for­matik der Univer­si­täts­me­dizin Göttingen sucht zum frühest­mög­lichen Eintritts­termin:

Bio-/Medizin-/Informatiker*in (w/m/d)

Teilzeit, 19,25 Stunden pro Woche, 12 Monate

Das Institut für Medizi­nische Bioin­for­matik arbeitet in Zusam­men­arbeit mit dem Göttinger Compre­hensive Cancer Center (G‑CCC) an trans­la­tio­nalen Forschungs­pro­jekten und der Digita­li­sierung der onkolo­gi­schen Versorgung. Der Forschungs­schwer­punkt der Medizi­ni­schen Bioin­for­matik liegt dabei auf der Analyse biome­di­zi­ni­scher Daten und deren Anwendung in der System­me­dizin. Wir entwi­ckeln und optimieren statis­tische und bioin­for­ma­tische Verfahren zur Auswertung hochdi­men­sio­naler Daten­sätze aus der biome­di­zi­ni­schen Forschung.
Das Univer­si­täts­Krebs­zentrum (G‑CCC) ist ein inter­dis­zi­pli­näres Zentrum, unter dessen Dach alle ökolo­gisch tätigen Kliniken und Institute der UMG vereint sind. Zusammen mit der Medizi­ni­schen Hochschule Hannover (MHH) fungiert es als Compre­hensive Cancer Center Nieder­sachen (CCCN) als eines der 15 Onkolo­gi­schen Spitzen­zentren, die von der Deutschen Krebs­hilfe gefördert werden.
Zur Unter­stützung unserer gemein­samen Projekte – insbe­sondere IMAGINE Nieder­sachsen – suchen wir zum nächst­mög­lichen Zeitpunkt Verstärkung.Im Rahmen von IMAGINE Nieder­sachsen entwi­ckeln wir ein digitales Unter­stüt­zungs­system zur Optimierung der vernetzten Krebs­ver­sorgung. Ziel ist es, Prozesse und Workflows sektoren­über­greifend zu harmo­ni­sieren, um eine patien­ten­freund­liche, standar­di­sierte und quali­tativ hochwertige Behandlung sicher­zu­stellen. Der Fokus liegt dabei auf der Vernetzung spezia­li­sierter Tumor­boards, der struk­tu­rierten Integration von Bildgebungs‑, Patho­­­logie- und klini­schen Daten sowie der Nutzung etablierter IT-Platt­­­formen und des Klini­schen Krebs­re­gisters Nieder­sachsen (KKN). Langfristig soll das Projekt eine nachhaltige, digital gestützte und quali­täts­kon­trol­lierte Vernetzung ermög­lichen, die über Nieder­sachsen hinaus Modell­cha­rakter für eine moderne onkolo­gische Versorgung haben kann.

Ihre Aufgaben

  • Erwei­terung unseres Tumor­do­ku­men­ta­ti­ons­ystems durch das Entwi­ckeln von Plugins
  • (Weiter-) Entwicklung von Prozessen zur Tumor­do­ku­men­tation in Zusam­men­arbeit mit externen
    Projekt­partnern und medizi­ni­schen Dokumen­taren
  • Entwicklung von Schnitt­stellen zum Austausch von Daten zwischen verschie­denen Klinik­sys­temen, Daten­bank­ab­fragen zur Daten­aus­wertung und –export
  • Etablierung von Prozess­work­flows in Koope­ration mit den Fachab­tei­lungen
  • Imple­men­tierung von Tools und Scripten zur Daten­ver­ar­beitung
  • Betreuung und Wartung von spezi­fi­schen Anwen­dungen aus dem Fachge­bieten des CCC
  • Fachüber­grei­fende Zusam­men­arbeit mit der Medizin­in­for­matik, der Bioin­for­matik, dem zentralen
    Rechen­zentrum sowie anderen Insti­tuten und Kliniken der UMG
  • Mitarbeit in Versor­gungs­for­schungs­pro­jekten, Entwicklung von Methoden zum daten­schutz­kon­formen Daten­aus­tausch mit Projekt­partnern bzw. Imple­men­tation der im Verbund entwi­ckelten Methoden an der UMG Zusam­men­arbeit mit dem Medizi­ni­schen Daten­in­te­gra­ti­ons­zentrum (MeDIC) der UMG zum Daten­aus­tausch und Pseud­ony­mi­sierung
  • Unter­stützung bei der Migration von trans­la­tio­nalen Forschungs­pro­jekten in die Routin­ever­sorgung
  • Erstellung und Pflege von Anfor­de­rungs­ana­lysen und Dokumen­ta­tionen

Ihre Quali­fi­ka­tionen

  • Hochschul­ab­schluss in der Fachrichtung Infor­matik, Bioin­for­matik, Medizi­nische Infor­matik, Data Science oder einem vergleich­baren Feld
  • Gutes Verständnis biome­di­zi­ni­scher Grund­lagen
  • Interesse an der Arbeit in einem inter­dis­zi­pli­nären Team
  • Gute Kennt­nisse in Python und Java, Kennt­nisse in R oder JavaScript sind vorteilhaft
  • Gute Kennt­nisse von Docker, Nginx etc sowie Erfahrung mit Betrieb von Anwen­dungen in komplexer Infra­struktur
  • Sichere Nutzung der Linux Shell
  • Gute Kennt­nisse in SQL, insbe­sondere für MySQL / MariaDB
  • Freude an der Arbeit mit komplexen Modellen
  • Sehr gute Deutsch- und Englisch­kennt­nisse in Wort und Schrift
  • Hohe Motivation, Teamfä­higkeit und Eigen­in­itiative

Wir bieten

  • Einen inter­es­santen Arbeits­platz in einem spannenden Bereich des Gesund­heits­wesens in einem motivierten, aufge­schlos­senen Team
  • Sorgfältige und quali­fi­zierte Einar­beitung und Unter­stützung bei der neuen Heraus­for­derung
  • Abwechs­lungs­reicher und verant­wor­tungs­voller Tätig­keits­be­reich mit indivi­du­ellen Entwick­lungs­mög­lich­keiten
  • Unter­stützung interner und externer Fort- und Weiter­bil­dungen sowie wissen­schaft­licher Veran­stal­tungen
  • Umfas­sende Angebote zur Gesund­heits­för­derung
  • Alle Leistungen des öffent­lichen Dienstes inkl. Zusatz­vor­sorge der Versor­gungs­an­stalt des Bundes und der Länder (VBL)

Wir freuen uns auf Ihre Bewerbung über unser Bewer­bungs­portal: UMG-Bewer­­­bungs­­­­­portal-Portal

Veröf­fent­licht: 12. December 2025

DASHH Call for Appli­ca­tions to the DAAD Graduate School Scholarship Programme

Are you a researcher outside Germany with a passion for data science? Have you considered a PhD in an inter­di­sci­plinary field to advance your career?

DASHH offers full-time GSSP scholar­ships for individual inter­di­sci­plinary PhD projects with a focus on struc­tural biology and computer science or applied mathe­matics in Hamburg, Germany. Together with two principal inves­ti­gators of our graduate school, you can develop an individual project proposal and apply for a three-year scholarship, which can be extended to up to four years.

Curious and want to learn more? Check the DASHH website at https://www.dashh.org/application/gssp_scholarships/index_eng.html.

The deadline for appli­ca­tions is March 1st, 2026.

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