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Job Offers

PhD project: Computational HTSeq-analysis of B-cells

We are one of the youngest universities in Germany and think in terms of
possibilities, not limitations. In the heart of the Ruhr region, we
develop ideas of the future at our 11 faculties. We are strong in
research and teaching, live diversity, support potential and are highly
committed to an educational equality that has earned this name.

The University Duisburg-Essen (Campus Essen), offers a position at the
Faculty of Biology, Research Group Bioinformatics and Computational
Biophysics as:
PhD-student
(65% part-time, salary equivalent TV-L 13)

Activities and responsibilities:
The successful applicant will work in a collaborative project on B cell
differentiation in the germinal center reaction and the resulting memory
B cell compartment in humans.

The focus will be on computational analyses of HTSeq data, specifically:
- analysis of scRNAseq data and HTSeq data of B-cell receptor repertoires
- probabilistic modeling and Bayes inference

The applicant will participate in the BIOME graduate school.

Qualification profile:
- at least 8 semesters of successful studies with a Master in
Bioinformatics, Biostatistics, Computational Biology, Biology or similar.
- solid background in bioinformatics and statistics (probabilistic
modeling, Bayes inference)
- familiarity with processing and analysis of HTSeq database
- very good programming skills, esp. with R
- knowledge of the biological background (B cells)
- good communication skills (incl. ability of writing and speaking
scientific english) and team working abilities

We offer:
- participation in cutting edge research project
- interesting job in an excellent team
- supplementary training opportunities
- sports and health offers (university sports)

Send application to
Applications (including a letter of motivation and a CV with contact
information of two references) and inquiries with reference code
jv-473-20 should be addressed by e-mail to: This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it.,
Universität Duisburg-Essen.

Wissenschaftliche*n Mitarbeiter*in (m/w/d) für Promotion oder Postdoc in Computational Pan-Genomics

Die Digitalisierung der Biomedizin und des Gesundheitswesens ist eine der
treibendsten Herausforderungen unserer Zeit. Die Erstellung, Weiterentwicklung
und Implementierung von Methoden, Werkzeugen und Software zur Unterstützung und
Verbesserung der modernen Biologie und Medizin ist daher eines der wichtigsten
Forschungsthemen an den Schnittstellen von Data Science und Computational
Biology. Die im Januar 2020 gegründete Gruppe „Genome Data Science“ (Lehrstuhl:
Prof. Dr. Alexander Schönhuth) wird den Schwerpunkt auf verwandte Themen der
rechnergestützten biomedizinischen Forschung legen. Die Forschung der Gruppe
wird zur Big-Data-Analyse und -Management, zu modernen
Hochdurchsatztechnologien, zum (effektiven und sicheren) Einsatz künstlicher
Intelligenz in der rechnergestützten personalisierten Medizin beitragen,
beispielsweise zur Optimierung von Therapiestrategien und zur Auswahl von
Behandlungsoptionen sowie zur Entwicklung und Implementierung von Mathematik
und Computertechniken, die den Zwecken der modernen Biomedizin dienen. Wir
suchen derzeit eine*n hochmotivierte*n Doktorand*in oder Postdoktorand*in für
unsere Gruppe. Die Arbeitssprache ist je nach persönlicher Präferenz Englisch
oder Deutsch. 

Das Profil aller erforderten Tätigkeiten umfasst:
 - Forschungstätigkeiten(75%)
 - DurchführungvonLehrveranstaltungen(20%)
 - MitarbeitinderakademischenSelbstverwaltung(5%)

Die entsprechenden Forschungs- und Publikationstätigkeiten beziehen sich
entweder auf das Gebiet der Computational Pan-Genomics oder der künstlichen
Intelligenz in der Biomedizin. Besondere Beispiele für mögliche Forschung sind:
 - Erstellungund Analyse neuartiger algorithmischer/mathematischer Strukturen
   und Indizes, die die Kartierung der genetischen Vielfalt ganzer Populationen
   unterstützen
 - Erstellungund Implementierung von Programmierrahmen, die die Analyse der
   genetischen Vielfalt von Krankheiten unterstützen
 - Entwicklung und Design von Pan-Genom-Darstellungen für
   Deep-Learning-Analysen
 - Entwicklung und Design von Architekturen für tiefe neuronale Netze zur
   Analyse von Multi-Omics-Datensätzen
 - Aufbau tiefer Netzwerkarchitekturen, um Vorhersagen aus diesen Darstellungen
   abzuleiten

Das genaue Thema kann im Rahmen von individuellen Diskussionen erarbeitet
werden. Für weitere Informationen, insbesondere bezüglich des 
Bewerbungsprozesses, siehe [LINKS]


LINKS: 

“Job announcement” https://www.uni-bielefeld.de/Universitaet/Aktuelles/Stellenausschreibungen/Anzeigen/Wiss/wiss20171_englisch.pdf 
“Stellenausschreibung” https://www.uni-bielefeld.de/Universitaet/Aktuelles/Stellenausschreibungen/Anzeigen/Wiss/wiss20171.pdf




Wissenschaftliche*n Mitarbeiter*in (m/w/d) für Promotion in Biomedical Data Science

ie Arbeitsgruppe „Biomedical Data Science“ (Lehrstuhl Prof. Dr. Alexander Schönhuth) wurde im Januar 2020 gegründet. Die Digitalisierung der Biomedizin und des Gesundheitswesens ist eines der bedeutsamsten Themen unserer Zeit. Die Idee dieser neuen Arbeitsgruppe ist, den Einsatz von computergestützter Hochdurchsatztechnologie („Big Data“), künstlicher Intelligenz und anderweitig relevanter informatischer und mathematischer Techniken in diesem Themenkreis voranzutreiben, und damit zur Schaffung moderner und individuell personalisierter Präzisionsmedizin auf ethisch vertretbare Art und Weise beizutragen. Für diese Arbeitsgruppe suchen wir eine*n wissenschaftliche*n Mitarbeiter*in. Die dabei durchgeführten Forschungstätigkeiten führen optimalerweise zur Promotion, die dem Bereich „Künstliche Intelligenz in der Biomedizin/Computergestützte personalisierte Medizin/Algorithmische Bioinformatik/Genomik/Einzelzellgenomik/Pan-Genomik“ zugewiesen werden kann.

Zu den Arbeitsbereichen gehören insbesondere:
 - Forschungs- und Publikationstätigkeiten (75 %) in den Bereichen
 - Deep Learning zum Verstehen/Diagnostizieren/Therapieren bislang unverstandener Krankheiten mit genetischem Hintergrund (zum Beispiel Amyotrophe Laterale Sklerose oder andere neuropathologische Konditionen, gewisse chronische Erkrankungen, insbesondere wenn diese Erkrankungen mit dem Mikrobiom in Zusammenhang stehen, oder Krebs)
 - Erarbeiten von Programmier-Frameworks, die sich mit der Analyse der genetischen Vielfalt von Krankheiten auseinandersetzen
 - Auswertung von Einzelzell-Experimenten („Single Cell Genomics“), als Präzisionsinstrument für das detaillierte Verständnis von zum Beispiel Krebs- und Immunsystemerkrankungen (möglicherweise auch als besonderer Schwerpunkt im Zusammenspiel mit den anderen Punkten)
 - Erschaffen neuer algorithmischer Strukturen, die die genetische Vielfalt von Bevölkerungen abbilden („Computational Pan- Genomics“).
 - Durchführung von Lehrveranstaltungen (20 %)
 - Mitarbeit in der akademischen Selbstverwaltung (5 %)

Das genaue Thema kann im Rahmen von individuellen Diskussionen erarbeitet werden. Für weitere Informationen, insbesondere bezüglich des Bewerbungsprozesses, siehe [LINK]


Links: 

“Job announcement” https://www.uni-bielefeld.de/Universitaet/Aktuelles/Stellenausschreibungen/Anzeigen/Wiss/wiss20140_englisch.pdf 
“Stellenausschreibung” https://www.uni-bielefeld.de/Universitaet/Aktuelles/Stellenausschreibungen/Anzeigen/Wiss/wiss20140.pdf


Postdoc position comparative genomics in planarian flatworms

The department of tissue dynamics and regeneration at MPI-BPC (https://www.mpibpc.mpg.de/rink) is offering fully funded postdoc opportunities in comparative genomics of planarian flatworms. Planarians are fascinating animals that can regenerate from tiny pieces, harbor adult pluripotent stem cells, scale their bodies over a wide size range and, as a taxonomic group, display a fascinating spectrum of regenerative abilities, body sizes, reproductive strategies or life expectancies from a few months to seeming immortality. Our group has pioneered planarian high-quality genome assemblies and we have established a large and phenotypically diverse species collection through world-wide field expeditions. Comparative genome mining now promises access to a wealth of intriguing research questions that include the probing of the genomic consequences of asexuality by means of comparisons between the sexually and asexually reproducing strains of S. mediterranea; body size evolution in the giant planarians of Lake Baikal or genomic adaptations to life in the lake’s abyssal zone (~ 1600 m depth); intra-organismal population genomics amongst the many independently replicating pluripotent stem cells or the dynamics and functional relevance of the new class of giant planarian retroelements that we discovered. Positions are available for talented individuals to pursue these or other questions. 

Your Profile 

  •       You have a PhD or equivalent degree in a relevant subject area, e.g., biology, computational biology or computer science and extensive hands-on experience with genomic data. 
  •       You have a proven track record in one or more of the following: genome assembly, multi-genome alignments; comparative genomics; structural genome variance; transposon mobility; cancer or evolutionary genomics; phylogenetics and or population genomics. 
  •       You are passionate about the scientific endeavor and you are not afraid of pursuing your questions beyond the current scientific frontier. 
  •       You are self-motivated and independent and enjoy being part of an international and interdisciplinary work environment. 

 About us 

We are a brand-new department at the Max Planck Institute for Biophysical Chemistry in the historic science town of Goettingen. We represent the organismal end of biophysical chemistry at the institute and investigate the mechanistic and evolutionary underpinnings of planarian regeneration. The department hosts a large zoo of planarian species for comparative analyses and we just established a field station at Lake Baikal in Russia, the Galapagos of planarian biodiversity. We are a thoroughly international and interdisciplinary group of people and based at one of Germany’s premier research campuses. We enjoy generous funding by the Max Planck Society and the proximity to picturesque Goettingen with its bustling student bars. 

 The Position 

The payment and benefits are based on the TVöD guidelines. Contracts are initially for 2 years, with the possibility of extension.

 

Interested? 

For more information, please contact This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it.

Please submit your application, including cover letter (explaining background and motivation), CV, transcripts, and publication record preferably via e-mail as one single PDF file to This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it. 



W2-Professur (m/w/d) Angewandte Bioinformatik [Hochschule Coburg]

Sie sind eine wissenschaftlich ausgewiesene Persönlichkeit mit einschlägiger Expertise in der Bioinformatik und Anwendungs-erfahrung in den Biowissenschaften. In der Lehre sollen die Bereiche der Datenanalyse und -management, Data Mining und Statistik in einem bioanalytischen Kontext vermittelt werden. In der Forschung ergänzen Sie die Expertise des Instituts für Bioanalytik (IBICO).

Wir sind ein engagiertes Team in einer forschungsstarken, national und international vernetzten Fakultät, das in kollegialer und fakultätsübergreifender Zusammenarbeit unser zukunftsweisendes Studienangebot ständig weiterentwickelt.

Sie haben Freude daran, auch in englischer Sprache, Forschung und Lehre in inspirierenden didaktischen Formaten zu verknüpfen?

Wir bieten mit dem IBICO eine hervorragend ausgestattete Infrastruktur für industrieorientierte, drittmittelfinanzierte Forschung.

Sie reizt es, Ihre anwendungsorientierte Erfahrung einzubringen, um das IBICO durch Ausbau des Projektportfolios regional/international weiterzuentwickeln und zu stärken?

Dann freuen wir uns über Ihre Bewerbung auf die ausgeschriebene Stelle!

 

An der Hochschule Coburg können Sie:

 

  • Lehre, Forschung und Transfer innovativ verknüpfen,
  • mit Kolleg*innen aus unterschiedlichen Fachdisziplinen an zukunftsrelevanten Themen arbeiten,
  • junge Menschen auf die Berufswelt von morgen vorzubereiten .

    Die Stadt Coburg als Kultur- und Familienstadt und die Genussregion Oberfranken bieten die besten Voraussetzungen für hohe Lebensqualität.

    Die Hochschule fördert ein verstärktes Engagement bei Projekten der angewandten Forschung sowie im Wissens- und Technolo-gietransfer. Die aktive Mitgestaltung der Bioanalytikstudiengänge und weiterer Studiengangskonzepte wird vorausgesetzt. Ebenso sind Aufgaben in der Selbstverwaltung der Hochschule wahrzunehmen.

 

Einstellungsvoraussetzungen:

 

  • Abgeschlossenes Hochschulstudium, vorzugsweise in der Bioinformatik oder in verwandten Disziplinen
  • Pädagogische Eignung; der Nachweis hierzu ist u.a. durch eine Probelehrveranstaltung zu erbringen
  • Besondere Befähigung zu wissenschaftlicher Arbeit, die durch eine Promotion oder promotionsadäquate Leistungen nach-gewiesen wird
  • Besondere Leistungen bei der Anwendung oder Entwicklung wissenschaftlicher Erkenntnisse und Methoden in einer mindestens fünfjährigen beruflichen Praxis, die nach Ab-schluss des Hochschulstudiums erworben sein muss und von der mindestens drei Jahre außerhalb des Hochschulbereichs ausgeübt worden sein müssen. Der Nachweis der außerhalb des Hochschulbereichs ausgeübten beruflichen Praxis kann in besonderen Fällen dadurch erfolgen, dass über einen Zeitraum von mindestens fünf Jahren ein erheblicher Teil der beruflichen Tätigkeit in Kooperation zwischen Hochschule und außerhochschulischer beruflicher Praxis erbracht wurde.
  • Es ist beabsichtigt, Sie bei Vorliegen der beamtenrechtlichen Voraussetzungen in ein Beamtenverhältnis auf Probe/Lebenszeit zu berufen. In das Beamtenverhältnis kann berufen werden, wer das 52. Lebensjahr noch nicht vollendet hat.

 

Bewerbungen von schwerbehinderten Menschen im Sinne des § 2 i.V.m. § 68 SGB IX werden bei sonst im Wesentlichen gleicher Eignung, Befähigung und fachlicher Leistung bevorzugt.

 

Die Hochschule Coburg hat sich die berufliche Förderung von Frauen zum Ziel gesetzt und begrüßt deshalb ausdrücklich Bewerbungen von Frauen.

 

Ansprechpartner

 

Auskünfte zur Ausschreibung können über das Sekretariat der Fakultät Angewandte Naturwissenschaften Tel. 09561 317-283 bzw. bei Prof. Dr. habil. Matthias Noll, Tel. 09561 317-645, E-Mail: This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it. eingeholt werden.

 

Bewerbungsfrist

 

09.07.2020

 

Weitere Stellenangebote

 

www.hs-coburg.de/stellenangebote

 

 

 

Links: https://stellenangebote.hs-coburg.de/jobposting/5fd78f5f58c2dd28e89b1f550f38f61ce8ceef2f0?ref=homepage

 

 

Bioinformatician on Genomics of Ageing

The Institute of Molecular Biology gGmbH

 

funded by the Boehringer Ingelheim Foundation

 

is recruiting a

Bioinformatician on Genomics of Ageing

(m/f/d)
(#CFBIO15)

 

 

The Institute of Molecular Biology (IMB) is a Centre of Excellence for Life Sciences, funded by the Boehringer Ingelheim Foundation, and located at the campus of the Johannes Gutenberg University in Mainz, Germany. The Bioinformatics Core Facility supports IMB researchers in the computational analysis of NGS and other “omics” data generated in the course of research projects. We are looking for a highly motivated Bioinformatician (m/f/d) to join our Core Facility team and establish a platform for analysis of biological ageing using diverse omics datasets.

 

You will:

·         Support biomedical scientists in Mainz in the planning, analysis, interpretation and publication of diverse NGS and other omics data sets in the context of aging research

·         Contribute to the development of bioinformatics workflows and pipelines

·         Provide bioinformatics consulting and software training to junior researchers

 

Required qualifications:

·         University degree or postgraduate training in computational biology / bioinformatics

·         Extensive and broad experience in the computational analysis of omics data

·         Solid programming skills and familiarity with Linux compute clusters

·         Sound knowledge of statistics, version control and R / Bioconductor

·         Strong interpersonal and communication skills, proficiency in English

 

Desirable qualifications:

·         Knowledge of software engineering and bioinformatics pipelines

·         Experience in interdisciplinary collaborations or bioinformatics services

 

We offer:

·         Stimulating, diverse and international research environment

·         Flexible working hours and advanced training opportunities

·         Favourable pension scheme

 

To apply, please send a single PDF file containing your cover letter, CV, certificates and contact information of at least two professional references quoting Ref. No. CFBIO15 to This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it.. IMB is an equal opportunity employer.

 

Starting Date:  as soon as possible

Duration:   initial contract for two years with an option for permanent employment

Application  Deadline:  September 1st 2020

Declaration of Consent and Data Protection

By sending us your application, you are consenting to us saving your personal data in order to carry out the selection process. You can find more information on data protection and retention periods at https://www.imb.de/jobs/data-protection.

Research Associates at the CDCS

The Center for Data and Computing in Natural Science (CDCS) is a new scientific institution formed as a partnership between the University of Hamburg, the Deutsche Elektronen-Synchrotron DESY and the Hamburg University of Technology. The CDCS is dedicated to the development and application of modern information technologies (Data Science, Artificial Intelligence, Scientific Computing) to complex scientific questions. With modern organisational concepts (so-called Cross-Disciplinary Labs) a flexible structure is created, which works integrative between the scientific groups of computer science and natural science.

The Center for Data and Computing in Natural Sciences (MIN Faculty) which is currently being formed invites applications for several

RESEARCH ASSOCIATES

The positions in accordance with Section 28 subsection 3 of the Hamburg higher education act (Hamburgisches Hochschulgesetz, HmbHG) commence on September 1, 2020.
A total of 11 postdoctoral positions will be filled in the CDCS, 3 of which will be in the Informatics Core Unit and 2 in each of the four thematic Cross-Disciplinary Labs. The thematic priorities of the CDLs are Astro- and Particle Physics (1), Photon Science (2), Systems Biology (3) and Control of Accelerators (4). The detailed job descriptions can be found on our website: https://uhh.de/cdcs-jobs

 

Scientific Researcher (f/m/x) Bioinformatics at the University Clinic Cologne

The Institute for Virology (Director: Univ.-Prof. Dr. Florian Klein) specializes in diagnostics and research pertaining to human pathogenic viruses. We apply a wide spectrum of molecular biological and bioinformatic techniques. Research topics include the identification and assessment of the development of viral resistance as well as research on new vaccination and therapeutic strategies. In collaboration with the Max Planck Institute for Informatics in Saarbrücken we have developed algorithms and implemented software (geno2pheno) that is used internationally and facilitates bioinformatic analyses of viral resistance for HIV as well as the hepatitis C and hepatitis B viruses. Together with Prof. Dr. Thomas Lengauer, who directed the development of the server and who is currently affiliated with our Institute we are continuing our research on the respective methods and applications. Furthermore we are extending our research to bacterial infections and cancer.
Your tasks:

  • Research on bioinformatic methods for processing and analyzing comprehensive genomic and clinical datasets (viral and bacterial infections)
  • Development, implementation and application of corresponding software
  • Support of porting the geno2pheno server from Saarbrücken to the University of Cologne and advancing the respective methods and software

Your Profile:

  • Master oder PhD in bioinformatics/computational biology, biostatistics, computer science or a closely relatedfield
  • Profound knowledge and experience with methods of statistics and statistical learning
  • Profound knowledge and experience with programming languages and environments (e.g. R, Python, C++,Perl, Java, Javascript; Oracle, Webserver), to be documented via central contributions to larger programming projects (programming experience within curricular courses or practicals is not sufficient)  
  • Proactive team player with excellent communication and writing skills

We offer:

  • A research environment that offers exciting and diverse opportunities
  • Flexible working hours
  • Perspectives for further scientific qualification
  • You will work in a highly interdisciplinary environment that is internationally excellently interconnected and provides opportunities for innovative research on patient-related and medically highly relevant topics. Collaboration with research groups in medicine, computational biology and computer science at Cologne University are existing or available. Your research will uniquely combine basic research on computational methods with medical applications. Perspectives for scientific advancement towards PhD or beyond are included in the profile of the position

Your salary will be based on TV-L, the position is time-limited (3 years).
Please supply the usual application materials incl. CV, documents and transcripts, publication list, research statement (detailed description of previous experiences in research and programming as well as sketch of research perspectives) and names of two references, here online. Applicatons should preferably be made online via https://jobs-uk-koeln.de/index.php?ac=jobad&id=1418 (click on the blue button at the bottom of the page). You can also apply via email to This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it..

Bioinformatics Engineer

Platomics develops a global marketplace for personalized medicine to make the future of molecular diagnostics available today. We are a young vibrant team and apply the most advanced computing technologies to enable big data processing and analysis in healthcare. Our backgrounds are in bioinformatics, genetics, software development, and mathematics. As a Bioinformatics Developer you will work at the core of the Platomics team where you have the opportunity to directly influence the way how personalize medicine is going to impact the future.

 

As a Bioinformatics Developer you have the following responsibilities:

  • Design and implementation of bioinformatics-based solutions for personalized medicine
  • Development of data-driven applications
  • Design and implementation of highly scalable, cloud-based microservices
  • Development of highly stable and well documented code for a medical application

 

Required qualifications:

  • University degree with focus on a computational discipline (Bioinformatics, Physics, Computational Chemistry, Computer Science, ...)
  • Professional development experience with Python
  • Enthusiasm to work in an interdisciplinary team
  • Not afraid of complex problems

 

Nice-to-haves:

  • Domain knowledge in Bioinformatics and Next Generation Sequencing
  • Familiarity with Molecular Biology or Medical Applications of NGS
  • Knowledge of Docker and Kubernetes
  • Hands-on experience with design of Microservices
  • Development experience with CUDA
  • Knowledge of machine learning frameworks (PyTorch, Keras, Tensorflow, ...)
  • Familiarity with agile software development
  • Experience with GitLab CI/CD pipelines
  • Proficiency in Linux and bash

 

 

We offer:

  • An interdisciplinary and dedicated team
  • Exciting challenges in a fast-evolving domain
  • Opportunity to work on cutting-edge technologies
  • A flexible work schedule
  • Convenient office location close to U1, U2 and U4 metro station Karlsplatz in Vienna

 

 

You’ll earn an appropriate salary starting at EUR 58.000 gross. Willingness for over-payment is given for candidates with proper experience and/or qualifications.

 

If you are interested in strengthening our development team please e-mail your CV, optionally including your GitHub/Kaggle/Datacamp profiles, to our HR department at This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it.

 

(Karlskirche) in the 4th district of Vienna.

 

Apply via: This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it. or call +43 660 222 03 95]

 

 

Links: https://www.platomics.com/bioinformatics-developer

(Bio‑)Informatikerin / (Bio‑)Informatiker (m/w/d) für Proteomics und cloud-Anwendungen

Kategorie

Wissenschaftl. Mitarbeiter(in)

Beschreibung

Die Ruhr-Universität Bochum (RUB) ist eine der führenden Forschungsuniversitäten in Deutschland. Als reformorientierte Campusuniversität vereint sie in einzigartiger Weise die gesamte Spannbreite der großen Wissenschaftsbereiche an einem Ort. Das dynamische Miteinander von Fächern und Fächerkulturen bietet den Forschenden wie den Studierenden gleichermaßen besondere Chancen zur interdisziplinären Zusammenarbeit.

Die Medizinische Bioinformatik sucht zum nächstmöglichen Zeitpunkt:

eine (Bio‑)Informatikerin / einen (Bio‑)Informatiker (m/w/d).

Die Medizinische Bioinformatik des Medizinischen Proteom-Centers (MPC) realisiert unter anderem das BMBF-drittmittelgeförderte Service-Center "Bioinformatik der Proteomik - BioInfra.Prot" des Deutschen Netzwerks für Bioinformatik Infrastruktur (www.denbi.de) und ist beteiligt am Europäischen Proteinforschungskonsortium PURE (http://www.pure.rub.de/) sowie an einem DGUV-geförderten Projekt zur Verifizierung von neuen molekularen Markern für die Frühdiagnose asbestassoziierter Lungentumoren.

Tätigkeiten:

    • Entwickeln neuer Algorithmen aus dem Bereich "Bioinformatik der Proteomik" und Implementierung dieser in wissenschaftliche Auswerte-Software

    • Auswertung proteomischer Daten

    • Unterstützung von Wissenschaftlern bei der Auswertung proteomischer Daten und der Anwendung von Auswerte-Software

    • Anpassen / Weiterentwickeln von wissenschaftlicher Auswerte-Software aus dem Bereich “Bioinformatik der Proteomik” für die Benutzung in cloud-Infrastrukturen (z. B. de.NBI-cloud)

    • Unterstützung bei der Etablierung der wissenschaftlichen cloud -Infrastruktur

 

Anforderungsprofil

Sie haben Kenntnisse und / oder Erfahrungen in den folgenden Bereichen der Informatik / Bioinformatik:

    • Abgeschlossenes Studium der (Bio-)Informatik oder vergleichbarem Studiengang (Master oder Diplom)

    • Administration von Linux-Betriebssystemen, Linux-Skript-Programmierung

    • Objektorientierte Programmierung (z. B. Python, Java, C++)

 

Wünschenswert sind Kenntnisse und Interesse an:

    • Verteiltes Rechnen und/oder Virtualisierung und Containerization

    • Bioinformatik-Algorithmen, Bioinformatik der Proteomik

    • Auswertung biologischer Hochdurchsatz- / Omics-Daten

    • Administration von Windows-Betriebssystemen

    • OpenStack

Erfolgt die Finanzierung bei der Einstellung ausschließlich von externen Drittmittelgebern, besteht für die Beschäftigten keine Verpflichtung zur Übernahme von Lehrverpflichtung.

Wir wollen an der Ruhr-Universität Bochum besonders die Karrieren von Frauen in den Bereichen, in denen sie unterrepräsentiert sind, fördern und freuen uns daher sehr über Bewerberinnen. Auch die Bewerbungen geeigneter schwerbehinderter und gleichgestellter Bewerber und Bewerberinnen sind herzlich willkommen. Fahrtkosten für evtl. Bewerbungsgespräche können nicht erstattet werden. Die Rücksendung von Bewerbungsunterlagen kann nur erfolgen, wenn ein adressierter und frankierter Rückumschlag beigefügt wird.

 

Kontaktdaten

Ansprechpartner

Herr Dr. Markus Stepath

Einsatzort

Gesundheitscampus

4

44801 Bochum

Deutschland

Telefon

+49 234 32 18111

E-Mail

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Art der Beschäftigung

Vollzeit

Weitere Informationen

Institut / Einrichtung

Medizinisches Proteom-Center

Zeitraum der Beschäftigung

nächstmöglicher Zeitpunkt bis 31.12.2021

Bewerbungsfristende

Donnerstag, 21. Mai 2020 - 23:59

Vergütung

TV-L E13 (100%)

 

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