Titelbild Bioinformatik - Ein Leitfaden für Naturwissenschaftler

Bioinformatik - Ein Leitfaden für Naturwissenschaftler


Andrea Hansen
Birkhäuser Verlag 2004, 2. erweiterte und überarbeitete Auflage, 156 S.
Aktualisierungen unter: http://www.bioinformatik.de/mybooks
ISBN 3-7643-6512-9

Erscheinungsdatum: September 2004
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Über das Buch
Inhaltsverzeichnis
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Über das Buch

Wie berechnet man multiple Alignments? Wie nutzt man eine Datenbank, um die mühsam im Labor ermittelten Sequenzen effektiv zu analysieren? Und welche Datenbank ist überhaupt am besten geeignet? Locker und leicht verständlich geschrieben führt dieser Leitfaden in die Geheimnisse der Bioinformatik ein, ohne dass man als Naturwissenschaftler gleich Informatik im Nebenfach belegt haben muss. Schwerpunkt des Buches sind die Grundlagen und verschiedenen Möglichkeiten der Sequenzanalyse.
Das Buch beginnt mit einer Einführung in die wichtigen Sequenzdatendatenbanken am NCBI und EMBL sowie in die wachsende Zahl der Motivdatenbanken. Anschliessend werden die einfachsten Methoden des paarweisen Sequenzvergleiches in globalen und lokalen Alignments beschrieben sowie die gängigsten heuristischen Verfahren der Datenbanksuche (fasta und blast). Multiple Alignments, Substitutionsmatrizen und die Berechnung phylogenetischer Bäume werden dem Leser nahe gebracht. Neu hinzugekommen sind auch Erläuterungen der Prinzipien der Genomanalyse und der gängigsten Algorithmen zur Genvorhersage. Zu jeder Methode werden Online-Tools im Internet oder freie Software angegeben. Der Leser wird so in die Lage versetzt, die beschriebenen Methoden selbstständig nachzuvollziehen.
Die Autorin selbst ist Molekularbiologin und in der Bioinformatik-Branche tätig. Als ehemalige Betreuerin eines Bioinformatik-Kurses für Studenten weiss sie aus eigener Erfahrung, auf welche Informationen es ankommt, um schnell und zielorientiert zu den gewünschten Ergebnissen zu gelangen. Das Buch richtet sich in erster Linie an Anwender und Einsteiger in die Bioinformatik. Angesprochen sind vor allem Studenten und Forscher aus allen Gebieten der Naturwissenschaften, die sich in Studium oder Beruf mit der Sequenzanalyse auseinandersetzen müssen. Gleichzeitig ist dieses Buch auch ein Leitfaden für all diejenigen, die die aufgeführten Methoden zwar regelmässig benutzen, aber noch nie die Zeit gefunden haben, sich mit den Grundlagen auseinanderzusetzen.



Inhaltsverzeichnis

  1. Einstieg in die Sequenzanalyse

  2. Primäre Datenbanken

  3. Sequenzformate

  4. Einfache Alignments

  5. Heuristische Methoden zum Sequenzvergleich

  6. Multiple Alignments

  7. Phylogenetische Analysen

  8. Abgeleitete Datenbanken
  9. Primerdesign

  10. Genomanalyse

  11. Glossar

  12. Weblinks

  13. Literaturverzeichnis

  14. Index



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Andrea Hansen
Last modified: Mon Sep 6 16:54:01 CEST 2004